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    Cancer Cell:荷兰学者发表肿瘤液态活检新方法

    摘要 : 2017年8月15日,国际著名学术杂志《Cell》子刊、癌症研究领域顶级学术期刊《Cancer Cell》在线发表了荷兰阿姆斯特丹自由大学Myron G. Best研究员和Thomas Wurdinger研究员的一篇研究论文论文报道了研究人员设计了一种液体活检新方法。

    亚美娱乐app www.yynm360.com 2017年8月15日,国际著名学术杂志《Cell》子刊、癌症研究领域顶级学术期刊《Cancer Cell》在线发表了荷兰阿姆斯特丹自由大学Myron G. Best研究员和Thomas Wurdinger研究员的一篇研究论文论文报道了研究人员设计了一种液体活检新方法。与在血液中寻找癌症DNA或其他生物标志物不同,该方法(名为thromboSeq)通过检测循环血小板吸收的肿瘤RNA,可以诊断非小细胞肺癌,准确度近90%。

    Myron G. Best说:“基于液体活检的癌症检测的目的是在早期阶段检测所有癌症。ThromboSeq可能不仅可以提供肺癌诊断,还可能诊断其他类型肿瘤,并可能给肿瘤分型。”

    血小板对一系列炎性事件和癌症有反应。由于血小板不具有细胞核,因此血小板中发现的所有RNA都来自巨核细胞或血液中血小板吸收的RNA。无癌症人群中的血小板含有一种不同的RNA汇编。

    研究人员研究了700多人的血液样本,其中包括诊断为晚期非小细胞肺癌的患者、较早的早期癌症组和未知癌症的对照组。而多发性硬化症、慢性胰腺炎和冠状动脉疾病等疾病的患者也被包括在对照组中,以确保算法能筛选癌症特异性RNA。

    ThromboSeq扫描了血小板中发现的大约5000种不同的RNA分子,并连续优化其RNA基因组,使其能到达少数标识肿瘤的RNA。然后,研究人员对血液样本进行筛查测试,以测试诊断癌症的准确率。

    结果显示,thromboSeq测试可以诊断早期癌症,准确率为81%,晚期癌症诊断的准确率为88%。在年龄、吸烟状况和血液储存时间的控制组中,该算法的准确度高达91%。Best相信该技术足够稳健,可以开始进行临床试验。

    “尽管血小板检测目前还没有提供完美的预测,但它可作为生物来源液体活检的补充替代。”Best说。

    研究人员计划在疑似肺癌但尚未诊断的人群中进一步优化算法,并进行更多试验,并致力于进一步了解在癌症状态下血小板培育的生物学机制。

    原文链接:

    Swarm Intelligence-Enhanced Detection of Non-Small-Cell Lung Cancer Using Tumor-Educated Platelets

    原文摘要:

    Blood-based liquid biopsies, including tumor-educated blood platelets (TEPs), have emerged as promising biomarker sources for non-invasive detection of cancer. Here we demonstrate that particle-swarm optimization (PSO)-enhanced algorithms enable efficient selecion of RNA biomarker panels from platelet RNA-sequencing libraries (n = 779). This resulted in accurate TEP-based detection of early- and late-stage non-small-cell lung cancer (n = 518 late-stage validation cohort, accuracy, 88%; AUC, 0.94; 95% CI, 0.92–0.96; p < 0.001; n = 106 early-stage validation cohort, accuracy, 81%; AUC, 0.89; 95% CI, 0.83–0.95; p < 0.001), independent of age of the individuals, smoking habits, whole-blood storage time, and various inflammatory conditions. PSO enabled selecion of gene panels to diagnose cancer from TEPs, suggesting that swarm intelligence may also benefit the optimization of diagnostics readout of other liquid biopsy biosources.

    来源: Cancer Cell 浏览次数:0

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